根据所承担的社会功能、职责任务、服务对象和资源配置状况以及日常工作需要，中轻食品工业管理中心共设立四个处（室）：办公室（行政人事、财务）、生产
科技处、行业管理处、咨询服务处。除直属处（室）之外，食品中心还负责联络八个食品行业协会、一个学会和八个食品标准化技术委员会的相关工作。
八个食品行业协会包括：中国酒业协会、中国糖业协会、中国生物发酵产业协会、中国食品添加剂和配料协会、中国焙烤食品糖制品工业协会、中国罐头工业协会、中国乳制品工业协会、中国饮料工业协会。
一个学会是中国食品科学技术学会。
八个食品标准化技术委员会包括：全国食品工业标准化技术委员会（TC64）、全国食品标签标准化技术委员会(TC473)、全国酿酒标准化技术委员会
(TC471)、全国白酒标准化技术委员会(TC358)、全国制糖标准化技术委员会(TC373)、全国饮料标准化技术委员会(TC275)、全国乳制
品标准化技术委员会，中国焙烤食品糖制品工业协会法规与技术委员会。
